气愤啊！国务院10年前就批准赤壁为省辖市

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楼主要补习下语文了。这句话应该这样断句：
（3）新设的咸宁市  辖咸安区，及原咸宁地区的嘉鱼县、通城县、崇阳县、通山县、原咸宁地区的赤壁市   由省直辖。

是说咸宁市由省直辖，根据顿号来分析，赤壁市与其他地区并列，都是咸宁下辖的。
按照楼主的理解，这句话的标点应该是：

新设的咸宁市辖咸安区，及原咸宁地区的嘉鱼县、通城县、崇阳县、通山县。原咸宁地区的赤壁市由省直辖。